Your table occupy aproximately 2/3 of page, so it not need to be set as long table. As longtable
you have problems with broke multirow
cells which can result with spurious empty cells on the next page and not centered content position an previous page.
Regarding use of rules from booktas
package you should consider above comments, however you can use it if delete extra verticals pace above and below of rules and additional space define by \makegapedcells
macro from `makecell˙package.
In multi line multirow
is not necessary to have parbox
. Recent version of multirow
package offer option {=}
which in multirow cells perserve column formatting.
\documentclass{article}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{array,booktabs,makecell,multirow,longtable}
\renewcommand\theadfont{\bfseries\normalsize}
\begin{document}
\begin{table}[htb]
\setlength\aboverulesep{0pt}
\setlength\belowrulesep{0pt}
\setcellgapes{3pt}
\makegapedcells
\begin{tabular}{|>{\bfseries}p{3cm}|>{\bfseries}p{3cm}|c|}
\toprule
& \thead[b]{Catégorie des\\ caractéristiques}
& \thead[b]{Caractéristiques} \\
\midrule
\multirow{10}{=}[-3em]{Analyses sur World of Warcraft [WoW]}
& \multirow{5}{=}[-2em]{Composition}
& Nombre de membres \\
\cmidrule{3-3} & & Entropie de distribution \\
\cmidrule{3-3} & & Pourcentage des classes présentes \\
\cmidrule{3-3} & & Longueur d’existence \\
\cmidrule{3-3} & & Écart-type des effectifs \\
\cmidrule{2-3} & \multirow{2}{=}[-1ex]{Stats du jeu}
& Temps de collaboration moyen \\
\cmidrule{3-3} & & Temps moyen de jeu dans un groupe \\
\cmidrule{2-3} & \multirow{3}{=}[-1em]{Structurelles}
& Entropie de distribution du degré \\
\cmidrule{3-3} & & Coefficient moyen de Clustering dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Coefficient moyen de Clustering \\
\midrule
\multirow{10}{=}[-4em]{Analyses sur DBLP}
& \multirow{2}{=}[-1ex]{Groupe}
& Nombre de membres \\
\cmidrule{3-3} & & Prolificité moyenne \\
\cmidrule{2-3} & \multirow{7}{=}[-3em]{Activités}
& Nombre total des publications dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre total des collaborations dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre total des publications dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre total des publications en dehors un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre moyen des collaborations dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre total des collaborations en dehors un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Coefficient moyen de fidélité des membres \\
\cmidrule{2-3} & Structurelles
& Entropie de la distribution des degrés \\
\bottomrule
\end{tabular}
\end{table}
\end{document}

Addendum:
In case, that you persist to have longtable
and accept empty vertical space when manual breaking of table (as suggested in Sveinung answer), then the MWE is
\documentclass{article}
\usepackage[utf8]{inputenc}
\usepackage{array,booktabs,makecell,multirow,longtable}
\renewcommand\theadfont{\bfseries\normalsize}
\usepackage{lipsum}
\begin{document}
\lipsum[1]
{
\setlength\aboverulesep{0pt}
\setlength\belowrulesep{0pt}
\setcellgapes{3pt}
\makegapedcells
\begin{longtable}{|>{\bfseries}p{3cm}|>{\bfseries}p{3cm}|c|}
\caption{Example of long table. For final form of table it have to be complied at list twice.}
\label{table1} \\
\toprule
& \thead[b]{Catégorie des\\ caractéristiques}
& \thead[b]{Caractéristiques} \\
\midrule
\endfirsthead
\toprule
& \thead[b]{Catégorie des\\ caractéristiques}
& \thead[b]{Caractéristiques} \\
\endhead
\bottomrule
\endfoot
\bottomrule
\endlastfoot
\multirow{10}{=}[-3em]{Analyses sur World of Warcraft [WoW]}
& \multirow{5}{=}[-2em]{Composition}
& Nombre de membres \\
\cmidrule{3-3} & & Entropie de distribution \\
\cmidrule{3-3} & & Pourcentage des classes présentes \\
\cmidrule{3-3} & & Longueur d’existence \\
\cmidrule{3-3} & & Écart-type des effectifs \\
\cmidrule{2-3} & \multirow{2}{=}[-1ex]{Stats du jeu}
& Temps de collaboration moyen \\
\cmidrule{3-3} & & Temps moyen de jeu dans un groupe \\
\cmidrule{2-3} & \multirow{3}{=}[-1em]{Structurelles}
& Entropie de distribution du degré \\
\cmidrule{3-3} & & Coefficient moyen de Clustering dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Coefficient moyen de Clustering \\
\pagebreak
\multirow{10}{=}[-4em]{Analyses sur DBLP}
& \multirow{2}{=}[-1ex]{Groupe}
& Nombre de membres \\
\cmidrule{3-3} & & Prolificité moyenne \\
\cmidrule{2-3} & \multirow{7}{=}[-3em]{Activités}
& Nombre total des publications dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre total des collaborations dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre total des publications dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre total des publications en dehors un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre moyen des collaborations dans un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Nombre total des collaborations en dehors un groupe \\
\cmidrule{3-3} & & Coefficient moyen de fidélité des membres \\
\cmidrule{2-3} & Structurelles
& Entropie de la distribution des degrés \\
\end{longtable}
\end{document}
which (seeing by my eyes) gives ugly result:

longtable
cannot have page breaks inside cells, so that part is not really a problem.